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Análise de dados

  • Foto do escritor: Gabriela Goes da Cunha
    Gabriela Goes da Cunha
  • 11 de jan.
  • 2 min de leitura

Tabela 1: Dados do docking e do ADMET
Tabela 1: Dados do docking e do ADMET

Fonte: Autoras


Após organizar os dados do docking molecular e do ADMET em uma tabela, foi necessário normalizar os valores para depois comparar os resultados dos compostos de forma holística. Assim, os dados foram padronizados em uma escala de 0 a 1, sendo 0 o pior desempenho e 1 o melhor desempenho do conjunto de dados. Para isso, foi realizada a normalização Min-Max. Quando o indicador indicava um valor alto como um bom resultado, foi utilizado a fórmula:


ree

Tal equação usa os valores mínimos e máximos da amostra. Assim, quando o melhor resultado é um valor alto, o maior valor entre as amostras recebe a nota 1, enquanto o menor valor entre os testes recebe a nota 0. Os demais rendimentos recebem uma nota proporcional a tais limites. Entretanto, quando o melhor resultado é um valor baixo, é necessário adaptar tal fórmula:


ree

Assim, na fórmula adaptada, o menor valor, o qual é o melhor resultado, recebe a nota normalizada de 1. Ademais, nos indicadores logP e logD7,4, o valor não importa desde que esteja dentro do limite estabelecido, que é, nesse caso, maior do que 1 e menor do que 3. Por isso, todos os compostos que tinham um valor dentro do limite nesses indicadores receberam a nota 1, enquanto os demais receberam a nota normalizada 0. Portanto, com os dados organizados, é possível formular uma nova tabela.


Tabela 2: Dados normalizados do docking e do ADMET
Tabela 2: Dados normalizados do docking e do ADMET

Fonte: Autoras


Nesses dados, foram aplicados pesos para ressaltar a importância de indicadores relacionados a viabilidade farmacêutica dos compostos, como, por exemplo, a toxicidade e a potência inibitória em relação ao objeto de estudo (exotoxina A). Desse modo, é possível calcular uma pontuação final para cada composto correspondente ao seu potencial terapêutico. A soma máxima é 100.


Tabela 3: Dados normalizados depois da aplicação de pesos
Tabela 3: Dados normalizados depois da aplicação de pesos

Fonte: Autoras


Assim, é possível elaborar um gráfico com o desempenho final dos compostos:


Figura 1: Pontuação final dos compostos
Figura 1: Pontuação final dos compostos

Fonte: Autoras


Portanto, é perceptível que Amostra 4 foi o composto com o melhor rendimento. Logo, com esses indicadores, tal amostra possui o melhor potencial terapêutico para o desenvolvimento de fármacos. Com a segunda maior nota, a Amostra 12 também é promissora, com uma nota ligeiramente maior que a da Amostra 11. Adicionalmente, a quarta maior pontuação é a do grupo controle, o PJ34. Além disso, a pior pontuação é a da Amostra 6, que não teve um resultado bom do docking quando comparado com os demais compostos. Por fim, a Amostra 3 também não teve um bom desempenho, uma vez que não tinha características físico-químicas adequadas para um fármaco.

 
 
 

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Conclusão

A presente averiguação, com foco primordial na exploração do potencial de compostos químicos como inibidores da exotoxina A da...

 
 
 

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R.E.A.C.T (Revolutionary Exotoxin A Combat Techniques): Design de inibidores da Exotoxina A da Pseudomonas aeruginosa projetados com Docking Molecular e in silico ADMET contra superbactérias de infecções nosocomiais (infecções hospitalares). © 2024 by Gabriela Goes da Cunha and Júlia Silva Djahjah is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International

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